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TCGA&GEO数据分析及癌症预后模型构建靶标筛选培训班
2023-05-11 325 返回列表

TCGA&GEO数据分析及癌症预后模型构建靶标筛选培训班


简介:

随着后基因组时代生信分析方法的不断完善和创新,临床与生信的关联越来越密切。我们可以通过高通量数据快速、准确、创新的筛选到自己课题方向相关的关键靶标以及机制。高通量数据来源广泛,总体分成两类:(1)采集样本进行测序(自有数据);(2)公共数据库中免费下载高通量数据。

公共数据库的数据样本量大,免费而且选择范围广。常见的数据库有TCGA数据库和NCBI GEO数据库,里面含有大量的不同研究方向的样本高通量数据。

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加!另外,其他疾病的研究可以通过GEO数据库进行。

本次培训不仅仅要大家了解多种不同的生信分析思路,学会TCGA & GEO数据库的基础操作,比如 数据筛选,下载,差异分析,功能通路分析,预后分析等等,还有复杂的预后模型构建筛选风险基因的实操内容。可以说是基础分析与高级分析并存。


注意事项:使用win7以上系统的电脑,上课软件为Cytoscape,Heml,GSEA,R和Rstudio。


办方:湖南省万行医学健康研究院

报名方式:周老师  13975103583(微信同号)  邮箱:edit57520@163.com


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