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宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化培训班
2023-05-11 309 返回列表

宏基因组与代谢组/脂质组R软件数据可视化培训班


背景介绍

微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例,人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10—— 越来越多的研究发现,肠道微生物与人体健康有着密切的关系,而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。

宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。

代谢组学和脂质组学是基于LC-MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物/脂质分子进行定性和相对定量分析。严格来讲,脂质组也是代谢组的一种。

宏基因组-代谢组/脂质组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性,从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系

基于以上原因医药加推出宏基因组+代谢组/脂质组联合分析R软件实操课程,带您充分挖掘数据,掌握生信高级分析能力。

 

主要内容

1. 宏基因组生信文章解读与报告解读;

2. RRstudio软件安装,宏基因组与代谢组/脂质组学联合分析实操;

3. 生信SCI文章实用数据处理与图片导出。

【培训预期】

本课程通过学习让我们对宏基因组肠道菌群分析,代谢组脂质组小分子分析,以及组学整合数据处理分析有一个全面的了解。并使用R语言进行分析及可视化作图,得到SCI水平的图片。

注意:携带windows系统的电脑64位以上系统,内存不低于4G,建议8G以上。安装最新版本R和Rstudio


办方:湖南省万行医学健康研究院

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